Здравствуйте. Если super().__new__(cls) возвращает ссылку на экземпляр класса, то как происходит создание экземпляра класса
Для начала - нужно обозначить несколько моментов.
Во-первых, все классы скрыто наследуются от базовой структуры Object.
(В 3.х версиях это не очень очевидно, но 2.х во 
многих случаях следовало явно наследоваться)
Функция super() обращается к классу-родителю и может вызывать его методы.
Собственно, поэтому этот кусок кода 
def __new__(cls, *args, **kwargs): 
        print('Вызов __new__  ' + str(cls))
        return super().__new__(cls)
можно описать как:
При создании экземпляра класса следует вывести текст после чего выполнить описанный в Object метод, создающий экземпляр класса и вернуть ссылку на него
то зачем возвращать ссылку на экземпляр класса?
Если метод, создающий экземпляр класса, не возвращает ссылку на него, зачем он нужен и как с таким классом взаимодействовать?