Я всегда восхищался сайтом
w3schools.com. Много лет назад (когда HTML4 ещё только набирал популярность) изучил по нему HTML, CSS, JS, XML, RDF, OWL, XSLT, позже этот же сайт помог мне быстро въехаться в ASP.Net. Там одновременно и не втирают элементарные вещи подолгу и не обделяют их вниманием (вдруг кто-то таки не знает). Что знаешь можно пропустить в один клик - там подача материала в формате визарда (как при инсталляции программ), кратенько и понятно по каждой атомарной теме, без принудительного прохождения каждой. В последнее время он стал чуть посложнее в плане собственной юзабилити, но и материалов добавилось. В Сети можно найти несколько сайтов-клонов w3schools с темами, которых нет на оригинале.
Профессионалом там, конечно, не станешь, но чтобы быстро въехать в тему, понять что есть что, к чему, как и где, заложить "скелет" понимания для дальнейшего обтягивания опытом и знаниями с помощью собственной практики и изысканий - ничего лучше я не видел (те же штуки типа codeschool грешат затянутостью и негибкостью, как мне кажется).
Также настоятельно рекомендую найти хороший редактор с мощным автодополнением и подсветкой. Время, когда всё имело смысл всё держать в голове прошло, как и время справочников-руководств, по сути - гораздо удобнее когда ты начинаешь писать что-то и редактор сразу тебе подсказывает какие есть варианты (со временем оно и запоминается отсюда). В этом плане я не видел ничего лучше (да и такого же, хотя бы), чем продукция JetBrains (в Вашем случае - WebStorm) и VisualStudio (с которой Вы, как я понимаю, уже знакомы), хотя знатоки рассказывают о чудесах EMACS и VIM.
Ну а дальше - рыскать по Сети в поисках интересных статей, книг, примеров.
По части JavaScript и jQuery мне не известно ничего лучше, чем творчество
Антона Шевчука.
По Bootstrap я бы сам не отказался от хорошей наводки.
Средний