А если серьезно - на какой результат вы рассчитываете?
Вы не привели код, да и если бы и привели, сомневаюсь, что в 1,3к строк стал бы кто-то копаться.
Максимум, что можно посоветовать - переписать по новой, изначально ориентируясь на много файловую структуру
Безусловно, можно попытаться разкидать по разным файлам и сшить их include/require, но с 99.9% вероятностью, это будет монструозное забаогованное нечто.
