То что Вы спрашиваете называется
авто_инкремент ,
но он в данном случае не очень нужен, так как user_id уникальный в телеграм, проще использовать в качестве ключа его - смотри пример кода
тут. Нужно 1 раз создать таблицу create_tables и потом наполнять её функцией register_user.
Если же надумаете добавить свой ид на основе автоинкремента, то просто изменить в коде как создаётся таблица и делает инсерт.