Вы не можете править файл App.xaml в визуальном редакторе потому, что он просто не предназначен для размещения элементов управления, вместо этого создавайте другие виды View (Window, UserControl, Page).
В App.xaml вы можете декларативно разместить ссылки на нужные ресурсы, стили, и т.п.
