График работы для компаний, как лучше привязать таблицу?

Тут вам нужно исходить из задачи (по вопросу она не до конца ясна).
Если у вас у одной компании одно или несколько расписаний, то через Foreign Key. При этом у всех компаний будут свои экземпляры расписаний.
А если вам нужно сделать так, что у нескольких компаний должно быть общее расписание, то... тоже Foreign Key в модели компании :)

ManyToMany - это связь многие к многим, т.е. когда "у вас вообще ничего не понятно" и любая компания может иметь либо свое расписание, либо чужое, либо и то и другое.

... если я конечно же правильно понял вопрос)