если возникает такой вопрос то однозначно create-react-app
про то что он не настраивается, это немного не так - никто не запрещает использовать вместо react-scripts что то другое и сохранить все плюсы create-react-app и добавить немного сахара
к примеру
https://github.com/kitze/custom-react-scripts
все плюсы create-react-app + декораторы + по мелочам что то
если вас полностью устраивает es6 то create-react-app вам за глаза
