Похоже, Jira вообще не содержит как такового встроенного механизма (сервиса, компонента), обновляющего индекс по расписаниям. Это нужно делать мануально, т.е. ручками, либо по API (Jira 6), либо писать свой сервис, скрипт, велосипед.
https://confluence.atlassian.com/display/JIRA051/S...
Закрываю вопрос.