Я думаю, что ломать роутер Joomla не хорошо (это касается всех выше перечисленных решений).
Попробуйте плагин редиректов, который будет проставлять 301 редирект, согласно корректному url с точки зрения Joomla.
joomline.ru/rasshirenija/plugin/jlnodubles.html
Кстати хочу заметить, что в большинстве компонентов и в самом ядре системы реализован тег canonical, который должен решать такие проблемы.