Не понятен вопрос!
Спрятать код? Не реально, JS клиентские язык работает в данном случае браузере.
Не хотите показывать "разваленный" ДОМ, прикрутите прелоадер.
$(window).on('load', '.preloader', function () {
$(this).fadeOut();
// или с помощью класса CSS
$(this).addClass('preloader-hide');
})
