1) Современные операционки и приложения хорошо используют многозадачность. Следовательно, 8 потоков Интела лучше, чем 6 АМД.
2) Разница в частоте очень сильно отразится на производительности ВМ. Снова в пользу Интел.
3) Кэш, скорость работы с памятью, "вылизанность программ", беспроблемность и долговечность - опять Интел.
=====================
P.S. В задачах виртуализации лишних ядер не бывает. Я бы брал Intel® Xeon® Processor E5-1650 v2.