Есть схожая
тема, но информация устарела.
Я использую PhpStorm 2021.1.1 и пункт "Align key-value pairs" находится не во вкладке "other" (её вообще нет), а во вкладке "Wrapping and Braces".
Подытожив, что бы реализовать автоматическое форматирование отступов в массиве необходимо перейти в "Editor"->"Code Style"->"PHP", на вкладке "Wrapping and Braces" спуститься к пункту "Array initializer" и выставить опцию "Align key-value pairs"