Не уверен что у меня аккуратное решение, но вот что смог нагенерить:
1) если используете CI наверняка можно запустить параллельно второй проект
2) запустить ант из мсбилда
3) написать свою таску для мсбилда
4) и вот только что наткнулся на ссылку...
http://www.msbuildextensionpack.com