Вот тут с координатами
http://habrahabr.ru/blogs/personal/19955/
А иерархию по КЛАДР можно выцеплять и по эталонному справочнику индексов объектов почтовой связи России отсеять устаревшую инфу
ссылки на них тут
http://xpoint.ru/know-how/PoleznyieSsyilki/PublicDatabases/Gazetteers?2
По мотивам топиков на хабре:
Гуль по: site:habrahabr.ru КЛАДР координаты городов 
