wisgest

На AutoHotkey можно периодически проверять положение указателя (см. MouseGetPos; русский перевод)

MouseGetPos x0, y0
Loop {
	Sleep 1
	MouseGetPos x1, y1
} Until x0 "," y0 != x1 "," y1

после чего вызвать одну из команд Process Close, WinClose или WinKill…

По-видимому, подойдёт и AutoIt (en|ru).

Имеется также (не проверял) пример работы с мышью на VBScript (используются объект автоматизации Excel и VBA).

Для Windows ищите сведения о файле autorun.inf, но если раньше такая возможность была по умолчанию включена, то теперь обычно наоборот. Для Linux, возможно, autorun.sh, — по крайней мере, такой файл, наряду с autorun.inf, присутствует у меня на 3G-модеме.

autohotkey не работает для движений мыши

Работает: AutoHotkey.com/docs/commands/MouseMove.htm