У Glassfish есть аутентификация по сертификату и принудительная работа через SSL…
Однако с шифрованием Glassfish справляется плохо, поэтому перед ним как правило ставят Apache и настраивают его для работы в роли Прокси. На нем соответственно и настроите openpgp.
PS: сначала не туда написал…
