GiveaFuck: вариантов много. обычно узкое место - база данных. если выполняете несколько запросов параллельно - может быть ограничение на количество соединений, к примеру.
Антон Ахмедалиев: вероятнее всего импорт выполнился не полностью - оборвался в каком-то месте.
выполните импорт по частям - по одной/несколько таблиц за раз.