Непонятен вопрос. Дебажится абсолютно точно так же, как и страница без вышеуказанного. Если в качестве дебаггера используется xdebug, то проще всего, конечно, поставить расширение для браузера (есть и для Хрома, и для Фокса), где режим дебага включается одним кликом. И тогда процесс становится простым до безобразия:
1) В PhpStorm ставите брекпойнт и включаете режим отладки
2) Открываете форму, которую надо заполнить, и также включаете режим отладки
3) Вводите данные, сабмитите форму и ловите в PhpStorm
