vladimirchelyabinskiy

В конфиге mysql 100% должно быть слово [mysqld] [myisamchk]
или порт 3306 ищите во всем каталоге сервера по этому тексту и наткнетесь на конфиг.

Ну вот на изображении видно что уже есть различия во времени, то есть по немногу скорость всетаки падает.... mysql 5.6.19 x64 тот же конфиг.