Не смотря на прошедшее время, дополню свой вопрос.
Спеки компа:
- i7 960
- DDR3 1600
- SSD на 6 GB/s sata порту
Приложения:
- в основном PHP-driven: Yii, Mediawiki, Wordpress и т.п.
Перепробованы как почти все сборки так и ручная установка всех компонентов по отдельности в разных конфигах. Результат все-равно примерно одинаков: простенькая VDS летает быстрее, чем локальный комп.
Думаю, это у меня такая мистика :)