Основы Линукса — это основы Юникса в целом. Мне понравилось как описаны основы в книге М.Эбен, Б. Таймен «FreeBSD: Platinum Edition» или что-то такое. Про FreeBSD там читать не надо, но про основные команды, права доступа и т.п. там описано достаточно ясно. Дальше можно читать статьи конкретно про Linux.
