Dmitry T.

Попробуйте воспользоваться переменной $args.
Нечто вроде:

proxy_pass http://$1/$2?$args

location /test.js {
  fastcgi_pass fastcgi;
  fastcgi_index index.php;
  fastcgi_param SCRIPT_FILENAME /php/test.js.php;
}

fastcgi не использовал с nginx, поэтому не могу больше подсказать. Возможно надо будет подправить что-то с fastcgi параметрами.

Попробуйте изменить значение proxy_cache_key

Я например использую — proxy_cache_key "$request_method|$http_if_none_match|$host|$uri$args"

p.s. кстати, попробуйте добавить к аксес логу '"$upstream_addr" "$upstream_response_time" "$upstream_status" $upstream_cache_status', будет удобнее делать дебаг кеширования.