Может разные таблицы (с разной структурой) хранить/импортировать в разные таблицы => MyCoolTable001, MyCoolTable002 ...
А в крайнем случае еще создать метатаблицу в которой хранить что MyCoolTable001 был импортирован из D:\Важные данные\111.xlsx в 2015-05-06 04:34:57.