Вы на сервере смотрите сколько памяти занято, вполне возможно что она просто зарезервирована а не действительно занята, скорее всего это счетчик просто кривой, с vzом это нормально.
Во-первых, вам стоит отказаться от apache, во вторых, сentalt вроде больше не поддерживается (?), на работе в основном используем remi, но у нас еще есть свой репозиторий, точнее зеркало с разных репо (например для nginx с geoip).
