Constantine Karnaukhov

В комментах к самому вопросу напихали тебе по самое не хочу и местами даже по делу. Но возможно в твоем случае по другому никак не сделать. Лично я за первый вариант. Самому приходилось патчить загрузчик композера на ряде проектов, примерно так это выглядит:

<?php

use Composer\Autoload\ClassLoader;
use function Composer\Autoload\includeFile;

if (file_exists($composerAutoloaderPath = __DIR__ . '/../../../autoload.php')) {
    $patchedLoader = new class(require $composerAutoloaderPath) {
        private $loader;

        public function __construct(ClassLoader $loader)
        {
            $loader->unregister();
            $this->loader = $loader;
        }

        public function register($prepend = false): void
        {
            spl_autoload_register([$this, 'loadClass'], true, $prepend);
        }

        public function unregister(): void
        {
            spl_autoload_unregister([$this, 'loadClass']);
        }

        /**
         * Loads the given class or interface.
         * @param string $class The name of the class
         * @return bool True if loaded, null otherwise
         */
        public function loadClass($class): bool
        {
            if ($file = $this->loader->findFile($class)) {
                includeFile($file);

                // дополнительные патчи здесь

                return true;
            }

            return false;
        }
    };

    $patchedLoader->register(true);
}

Вместо vendor/autoload.php подключаешь файл со своим лоадером.

Этот вопрос ты можешь адресовать разработчикам пакетов которые я подключаю в своем проекте.

По этому моменту даже интересно какие пакеты навязывают использование глобального состояния.