Нужно уточнять у УЦ на каком криптопровайдере они смогут выдать вам эцп. Контейнеры ключей у КриптоПРО и ViPNet в разном формате поэтому использовать понравившийся не получится, необходима «совместимость с УЦ». Если есть возможность использовать ViPNet то лучше его конечно — ибо бесплатно, плюс имхо vipnet проще. КриптоАРМу все равно какой из них будет использоваться. Да есть небольшой момент, юридически вы должны использовать сертифицированную версию криптопровайдера, если у вас ОС win7 и ниже приобретайте(скачивайте) любой, если win8 то тут печально, с ней совместим и сертифицирован только КриптоПРО 3.6 R3, ViPNet CSP 4.0 сертификацию еще не прошел, он в бете, хотя из практики ставил, работает но с нюансами :). Как то так.