Вячеслав Саратовский

Проблема решилась изменением модели Session

var Schema = mongoose.Schema;

var schema = new Schema({
    _id:{
        type: String
    },
    session:{
        type: String
    },
    expires:{
        type: Date
    }
});

exports.Session = mongoose.model('Session', schema);

Поле _id надо тоже описывать.