sonca-ca

Изначально у вас сообщение про раскладку, когда проблема с капсом вы меняете сообщение, а вот когда новая проблема с раскладкой после капса, текст не меняется и выводится что было

if (isCyrillic(keyName)) { //вывод сообщения о не правильной раскладке
   //нужно добавить
    var modalWindowCaps = document.getElementById("alertWindowText");
    modalWindowCaps.innerHTML = ("Раскладка!");
    ...
}  else if (capsLockEnabled && keyName != null) {
    var modalWindowCaps = document.getElementById("alertWindowText");
    modalWindowCaps.innerHTML = ("Включен CapsLock!");
    ...
}