Попробуйте так же создать хочты из панели управления и замерять 10 раз в пиковое врямя.
На след день на другой версии столько же раз и по среднему сравните. Очень сильныи аномалии откиньте. И не должно быть никакой разницы в размере количестве отдаваемых данных не в насйтроках сервера.
ПС: Или поставьте debian 8 и забейте.
