Нашел подходящий вариант —
toggl.com
Есть возможность управлять тайм-трекером как через веб-интерфейс, так и с помощью клиентов под Win, Max, Lin, iPhone, Droid!
Что понравилось — при запуске счетчика времени на задачу в броузере, последующем закрытии браузера и работе с «настольной» версией — счетчик продолжил считать, как только десктопный клиент подключился к сети. Причем отсчет производится на стороне сервера, а это значит, что нет привязки к какому либо устройству.