Вы имеете в виду, что у Вас в транке уже есть какие-то комиты, которые деплоить пока не надо, но вот эту вот срочную последнюю фичу надо закомитить?
Если Вы будете на каждую задачу делать ветку, а деплоить через таги, то у вас такой ситуации просто не возникнет. Грубо говоря, в транк идут комиты (мержи из веток) только перед созданием тага. Т.е. почти в любой момент времени у вас транк соответвует последнему тагу, развернутому на продакшене. Все девелоперы работают в ветках. Появилась срочная задача? Пожалуйста, делаем ветку и потом мержим ее втранк, делаем новый таг, деплой. Или даже так: нет времени на ветки, фиксим прямо в транке, новый таг, деплой.
Посмотрите, я тут недавно описывал свой воркфлоу, который вполне работает:
habrahabr.ru/qa/7149/#answer_30727 
