Самый безопасный способ — P2V‑миграция (перенос с физического сервера в виртуальную среду). Мы раньше делали это через Acronis и VMware Converter, когда внедряли ESXi.
Сейчас я бы посмотрел в сторону StarWind V2V Converter или Veeam — оба позволяют конвертировать Windows Server в формат, совместимый с Proxmox.
При этом IP-адреса, SID и роли (например, контроллер домена) не меняются, если всё делать правильно, так что проблем с AD быть не должно.
Также важно по возможности избежать вложенной виртуализации — лучше перенести гостевые ВМ сразу в Proxmox, а не тянуть за собой весь Workstation.