Игра ничего не понимает. Автокликеры как правило просто посылают сообщение о вводе в message loop приложения. Но в играх, так как важно минимизировать задержку и используемые ресурсы, для обработки ввода используется специальное api, тот же xinput в винде. Движок игры просто не получает ваш ввод из приложения, вот и все. Если так надо, я бы копал в строну создания виртуального устройства ввода.
