Количество возможных конфликтов не связано с количеством коммитов и бренчей.
Если все ветки работают с разными файлами, разными каталогами - то проблем вообще не будет.
Никто не мешает попробовать сделать мерж в рабочий каталог на локальной машине (без коммитов), и посмотреть есть ли конфликты.
А вообще, должен быть архитектор и тим лиды, которые собственно и должны принимать решение.