Andy

Расшаривание папок конечно. Создай группы безопасности для каждой папки. Можно еще внедрить EFS и Bitlocker. RDP чисто для общих папок как-то не серьезно, если только эти пять компьютеров не в одном локальной сети с сервером.

Да, разделять конечно нужно. В промышленных масштабах хорошо бы базу данных и логи на отдельных дисках.