используй
LocalStorage если нужно что бы число сохранялось на всегда или
SessionStorage если только до перезагрузки браузера. И надобность в глобальной переменной отпадет
вот написал для вас:
$(function() {
var
stratDate = new Date('2019-05-09T20:40:00'), // Дата начала таймера
delayMinutes = 5, // количество минут на 1 тик таймера
differenceMinutes = Math.round((new Date() - stratDate) / 1000 / 60), // Получаем разницу в минутах
interval = (delayMinutes - (differenceMinutes % delayMinutes)) * 60000, // получаем начальный интервал
countTik = Math.floor(differenceMinutes / delayMinutes); // количество прошедших тиков таймера
console.log('прошло:', countTik, 'тиков\nдо следующего тика:', interval, 'ms'); // [не обязательно] вывожу информацию в консоль
setInterval(function() {
console.log('прошло:', countTik, 'тиков'); // [не обязательно] вывожу информацию в консоль
interval = delayMinutes * 60000; // Обновляем интервал
}, interval);
});