Можно попробовать скормить их ReGet'у: например, если имя вашего компьютера «AV» скормить регету такой путь — \\AV\C$\MyFolders\backup.rar — регет докачает, скажем до 70% тут нажмите на паузу и в свойствах закачки измените путь уже ко второму файлу по типу \\AV\C$\MyFolders\copy\backup.rar и продолжите закачку.