Для решения данной задачи есть два пути. Так как animate.css работает с помощью добавления классов, вам нужен плагин для слайдера ( если вы его используете), который позволят отлавливать события: когда слайд стал активным (чтобы добавлять класс animate) и когда слайд перестал быть активным (чтобы удалять эти классы для срабатывания анимации второй раз). Это был первый вариант. Второй вариант написать такой плагин самому.