Роман

Убрать дефис из названия ИДа
<button id="saveButton"></button>

Можно написать вот так. Выполняется все ок, просто браузер задумывается.

saveButton.onclick = () => {
      saveButton.hidden = true;
        for (i = 0; i < 9999; i++) {
          console.log(i);
        }
    }

или с задержкой, так выглядит лучше =)

saveButton.onclick = () => {
      saveButton.hidden = true;
      setTimeout(function() {
        for (i = 0; i < 9999; i++) {
          console.log(i);
        }
      }, 100)
    }

пы.сы. jQuery в 2к17... не надо так... =(