Что-то у вас явно не так пошло. Вы точно ./script/bootstrap выполни там, где надо ?
У вас хватает директории lib, где собсно и лежат джарники с кложурой. Что, кстати, вполне очевидно, если глазками посмотреть в тот скрипт, который вы запускаете. Пройдите еще раз все по шагам из инструкции. У меня вот лично, все запустилось.