1. Они будут создаваться абсолютно разными. Десктоп будет для сео, мобильная версия будет полностью реактивной (или как это по модному называется). Про методику mobilefirst читал. На сколько я сейчас представляю, лучше отказаться от использования одного и того же кода в обоих версиях и каждый пойдёт своим путём.