Ну конечно же, у вас исходное изображение без прозрачного фона, а сам фон никуда не пропадёт и прозрачным не станет, даже с режимом наложения screen. Вы просто видите результат наложения и если под изображением нет фона, то оно будет экспортировано в первоначальном виде т.е. со своим родным черным фоном.
Вам нужно сделать (найти, скачать, перерисовать) этот график с прозрачным фоном любым доступным способом.
