У меня ваш пример прекрасно работает.
Возможно вы забыли: \documentclass[12pt,a4paper]{article}
\documentclass[12pt,a4paper]{article}
\usepackage[english,russian]{babel}
\usepackage{fontspec}
\defaultfontfeatures{Ligatures={TeX},Renderer=Basic}
\setmainfont[Ligatures={TeX,Historic}]{Times New Roman}
\begin{document}
текст
\end{document}
Может проще напрямую у интересующего вас журнала спросить?
Из своего опыта сдачи рекламных материалов в узкоспециализированные издания, могу совершенно точно сказать, что TeX не берут.
Статьи принимаются в виде голого текста, практически без вёрстки, т.к. всё равно верстаются заново.