Переодически падали сервера из-за такой вот проблемы с кронами в статусе D. Гугление по англоязычным ресурсам привело к нахождению вот этого: "I have seen this happen before, it was always associated with a developing disk or disk controller fault. Check your hardware fault logs too."
В таком состоянии сервак вообще вел себя странно, попытки записать что-то на диск вешают процессы, а потом и всю систему (хотя, чтение отрабатывало). У себя на серваках я обновил ядро до последнего, попутно решились другие странные проблемы. Пока наблюдаю.