У меня такая же ошибка, однако у меня она не влечёт никаких последствий и код отрабатывает. Node-inspector показал, что она возникает где-то в ядре mongodb драйвера, который используется в mongoose. Соответственно, когда мы подключаем mongoose, тогда она и выскакивает.
В ридми драйвера вот что есть:
## Troubleshooting
The MongoDB driver depends on several other packages. These are.
* mongodb-core
* bson
* kerberos
* node-gyp
The `kerberos` package is a C++ extension that requires a build environment to be installed on your system. You must be able to build node.js itself to be able to compile and install the `kerberos` module. Furthermore the `kerberos` module requires the MIT Kerberos package to correctly compile on UNIX operating systems. Consult your UNIX operation system package manager what libraries to install.
{{% note class="important" %}}
Windows already contains the SSPI API used for Kerberos authentication. However you will need to install a full compiler tool chain using visual studio C++ to correctly install the kerberos extension.
{{% /note %}}
Так же в свежем апдейте драйвера в списке обновлений есть запись:
1.3.1 2016-02-05
----------------
- Removed annoying missing Kerberos error (NODE-654).
Вот ссылка на ошибку:
/NODE-654
Так что, я думаю, стоит просто обновить драйвер и ошибка исчезнет.
