nicandr

Максим Федоров правильно вам написал, вам нужен еще один слой который будет взаимодействовать с вашими репозиториями, в симфони как и в лбдом другом фреимворке вся логика должна быть в сервисе. Из вашего описания вы сделали facade паттерн чтобы в клиентском коде все бьло просто. Для этого подойдет сервис, который может который так же модет наследовать(implement) интерфейс.

interface CategoryRepositoryInterface
{
     public function findOne($id);
     public function findAll(): array;
     public function save(CategoryInterface $category);
     public function remove(CategoryInterface $category);
}
class CustomNameOfClass implements CategoryRepositoryInterface // ну тут имя лучше изменить
{
      public function findOne($id){};  // тут тоже лучше иметь return type
     public function findAll(){}: array;
     public function save(CategoryInterface $category){}; // тут тоже лучше иметь return type
     public function remove(CategoryInterface $category){}; // тут тоже лучше иметь return type
}

Так будет тоже самое что и сейчас у вас, только репозитории работают отдельно, и сервис слой их обьеденяет с вашей логикой. Репозитории не должны знать о существовании других репозиториев.
Поскльку у вас несколько репозиториев, создайте DTO и все данные после того как они преобразованы киньте в DTO, так у вас бьудет один стандартный обьект, над которым вы сможете выполнять дальнейшую логику.