Там же есть кнопка "применить для всей системы", + там есть возможность указать конфиг для прокси - посмотрите в сети как его составить, возможно и логин с паролем он будет сам вводить.
Так в браузерах уже Certificate Pinning работает, браузер знает сертификаты популярных сайтов, и посылает вас подальше с вашей дешевой подделкой.
Сомневаюсь что вы с этим что-то сделаете.
