с workbench все так, просто ну как бы phpmyadmin это вебинтерфейс и и не нужно ставить кучу клиентов на разные машины, плюсы при администрировании
Возможность запускать непосредственно на сервере, что удобно при хостинге и когда хостер запрещает удаленный доступ к базе.
$ ps aux | grep mysql // че выводит ?
$ lsof -i :port //номер порта какой у вас там в мампе настроен посмотрите не весит ли там чего
$ killall -9 mysqld
