Условно, если я вдруг подцеплю вирус на винде, сможет ли он проникнуть на вторую ОС (линукс)?
Если ты не будешь монтировать линуксовые разделы под Windows - то вирус их не увидит.
Здесь можно еще долго спорить на тему какие умные вирусы бывают но с моей точки зрения вирусы
бьют сразу в слабое место (шифруют файлы и поселяют майнеров и троянов) и не заморачиваются
поиском скрытых partitions.
Твой сценарий на самом деле не очень понятен. Если просто хочешь работать в Линуксе - то и работай.
А так - придумал себе лишних хлопот.