Ээээ, вы тогда компьютер особо не мучайте, что-бы ничего лишнего с верху не записать случайно. Если есть возможность, то сделайте dd копию диска с которым работаете на новый носитель. Потом смонтируйте этот образ в read-only и там уже нужно искать какими программами можно восстанавливать нужные вам файлы.
Можно потом будет открыть сделанную копию в любом адекватно читающем большие файлы редакторе и поискать нужные вам файлы. К примеру если это PHP файлы то искать вхождение <?php (или как у вас там) и восстанавливать их.